National Center for Biotechnology Information (NCBI) Националният център за биотехнологична информация (NCBI) стимулира науката и здравеопазването чрез предоставяне на достъп до биомедицинска и геномна информация. NCBI служи като международен ресурс за научноизследователската общност – осигуряване на достъп до публични бази данни и софтуерни инструменти за анализиране на биологичните данни, както и извършване на изследвания в областта на изчислителната биология. Основните бази данни, създадени и поддържани от NCBI включват: ДНК база данни Genbank, Gene, Protein, База данни за молекулярно моделиране (3D протеинови структури), OMIM (Онлайн тип Мендел онаследяване при човека), dB SNP (нуклеотиден полиморфизъм), Епигеномика, Референтната секвенционна колекция, карта на Човешкия геном, Таксономия, PubChem, PubMed и др |
DNA Data Bank of Japan (DDBJ) DDBJ е биологична база данни, която съдържа ДНК секвенции. Тя си сътрудничи и обменя биологична информация с EMBL и GenBank |
European Nucleotide Archive (ENA) ENA е безплатна биолологична база данни със свободен достъп, съдържаща нуклеотидни последователности, функционални анотации, секвенционни данни и информация за процеса на секвениране. Базите данни на ENA и другите база данни, част от INSDC (GenBank и DDBJ), съдържат пълните геноми на 5,682 организми и данни за секвенциите на почти 700 000 вида. |
UniProtKB UniProt базата данни предоставя изчерпателен, висококачествен и свободен достъп до ресурси за различни протеини и техните функционални особености. Тя е създадена чрез комбиниране на базата данни Swiss-Prot, TrEMBL и PIR-PSD. Биологичната информация е структурирана по следния начин: UniRef база данни (UniProt референтни клъстери); UniParc база данни, която съдържа повечето от публично достъпни протеинови последователности в света; и Proteome – база данни, предоставяща данни за протеома за видове с напълно секвенирани геноми. |
|
Prosite PROSITE се състои от файлове, описващи различни белтъчни домейни, семейства и функционални сайтове, както и свързани модели и профили за протеинова идентификация. |
|
InterPro InterPro е база данни с белтъчини семейства, домейни и функционални сайтове, които могат да се прилагат при функционалното характеризиране на нови протеини. |
|
Protein Data Bank (PDB) PDB е база данни със свободен достъп, предоставяща информация за триизмерните структури на големи биологични молекули, като протеини и нуклеинови киселини. Данните обикновено се получават чрез кристалографски анализ. |
|
RCSB Protein Data Bank RCSB е част от базата данни wwPDB. Той архивира и предоставя биологична информация за 3D структури на протеини, нуклеинови киселини и комплексни молекули с цел научни изследвания и обучение в областта на молекулярната, структурната и изчислителната биология. |
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) KEGG е референтна база данни, предоставяща знания за функциите и особеностите на молекулярно ниво на биологичните системи, такива като клетка, организъм или екосистема. |
Biotech gate Biotech gate е световна база данни за развитие на бизнеса, която дава достъп до информация за биотехнологичния, фармацевтичния, медицинския, високотехнологичния и други сектори, свързани с природните науки. Той съдържа над 600 000 клинични проучвания, включително редовни актуализирани проучвания за COVID-19; база данни за над 56 000 фирми; подробно функции за търсене с опции за изтегляне във формат Excel; специализирана база данни за инвеститори. |
OECD BioTrack Product Database Базата данни на OECD предоставя достъп до информация за продукти (храни и фуражи), одобрени за търговско приложение, които са получени при използването на модерна биотехнология или на конвенционални методи за кръстосване и мутагенез. |